Перед началом летнего сезона против клещевого энцефалита были привиты более 7,2 тысяч работников ВСЖД. Из них более тысячи прошли первичную вакцинацию и свыше 6,2 тысяч – ревакцинацию. Массовая прививочная кампания работников, имеющих риск заражения, накануне активации природно-очаговой вирусной инфекции на магистрали проводится ежегодно. В 2017 году для приобретения препарата российского производства негосударственными учреждениями здравоохранения ОАО «РЖД» на Восточно-Сибирской железной дороге было выделено порядка 4,9 млн рублей. Вакцина, не содержащая антибиотиков и консервантов, обладает высокой эффективностью против вируса клещевого энцефалита и не имеет ограничений на применение в сезон заражения.
Иммунизация проводится работникам «группы риска»: обходчикам путей, составителям поездов, дежурным по станциям и переездам, и другим представителям различных должностей железнодорожного транспорта, входящих в специальный перечень профессий, подлежащих обязательной вакцинации против клещевого вирусного энцефалита. Кроме того, все сотрудники ВСЖД, работающие в природных очагах, обеспечиваются защитной спецодеждой и репеллентами. В трудовых коллективах медиками проводится санитарно-просветительская работа.
В загородных летних оздоровительных и спортивных учреждениях дороги применяются соответствующие меры по преобразованию окружающей среды – санитарная очистка от бытового и строительного мусора, сухостоя и валежника, противоклещевая обработка спортивных трасс и территорий. К началу заездов в лагеря и санатории в необходимом количестве снабжаются средствами экстренной профилактики.