В период ухудшения погодных условий Восточно-Сибирская железная дорога подготовилась к борьбе с паводками. В границах магистрали организовано круглосуточное дежурство противоразмывных поездов. Они расположены на 12 станциях магистрали: Нижнеудинск, Черемхово, Слюдянка, Мысовая, Дивизионная, Гусиное Озеро, Лена, Коршуниха, Новый Уоян, Новая Чара, Таксимо и Северобайкальск.
Вагоны поездов укомплектованы путевым щебнем (1620 куб. м), песком и бутовым камнем (600 куб. м), 12 вагонов со шпалами (1200 шт.), а также всем необходимым для проведения работ по ликвидации подтоплений.
Под особым контролем находятся наиболее сложные участки, подверженные скальным обвалам и подтоплению. В границах дороги находится около 230 таких объектов. Они регулярно инспектируются.
Локомотивные бригады проходят специальный инструктаж по управлению поездом в местах возможных размывов и деформации земляного полотна.
Со структурами МЧС и местными органами власти отрабатываются схемы взаимодействия для предотвращения и ликвидации повреждения объектов железнодорожного транспорта при пропуске паводковых вод. Налажено сотрудничество с органами Гидрометеослужбы с целью получения оперативной гидрометеорологической информации.